医疗保障处负责各项医保政策及时、准确落地实施，承担医保协议管理、医保稽查、医保业务办理、医保往来账结算、物价管理等多项职能，承载了医保管理和服务的双重工作。
目前已全面开通跨省异地医保、省内异地医保、省机关医保、省企业医保、省离休干部、南昌市职工/机关医保、南昌各辖区县职工/居民医保、南昌市离休干部、大学生医保等各类参保人医疗费用的即时结算，极大方便广大医保病友在我院就医报销。
医保服务窗口目前位于收费3号窗口，为医保病人办理门诊特殊病种、双通道药品审批、外伤审核、医保咨询及各类医保相关业务。